Включить лог всех запросов

general_log.on.sql

SET global general_log_file='/var/log/mysql.log';
SET global general_log = ON;

Просмотреть состояние:

SHOW global VARIABLES LIKE '%general_log%';

Выключить:

SET global general_log = off;

Если нет возможности увидеть запросы в коде приложения, их можно поймать на стороне сервера. Чтобы включить лог всех запросов, включая ошибочные, необходимо изменить конфигурацию сервера MySQL 5.6+:

/etc/my.cnf.d/server.cnf

[mysqld]
general_log = on
general_log_file=/var/lib/mysql/all-queries.log

MySQL до 5.6:

/etc/my.cnf.d/server.cnf

[mysqld]
log=/var/lib/mysql/all-queries.log

Далее - перезагрузить сервер systemctl restart mysqld.service.

Пример лога:

Time                 Id Command    Argument
151217 12:10:20     2 Connect   root@localhost as anonymous on test
                    2 Query     show databases
                    2 Query     show tables
                    2 Field List        Document 
                    2 Field List        Field 
                    2 Field List        FieldMapping 
                    2 Query     select @@version_comment limit 1
151217 12:10:32     2 Query     show tables
151217 12:11:30     2 Query     select

Источник